Friday, October 3, 2008

uBio - Universal Biological Indexer and Organizer

I just heard about a biology taxonomy called uBio:

About uBio project

uBio is an initiative within the science library community to join international efforts to create and utilize a comprehensive and collaborative catalog of known names of all living (and once-living) organisms. The Taxonomic Name Server (TNS) catalogs names and classifications to enable tools that can help users find information on living things using any of the names that may be related to an organism.

I have no investigated it closely to determine whether it is simply a Web Service (SOAP interface) or whether it also is available on the Semantic Web (RDF).

More about what uBio does:

Information about organisms is often linked to a name.

This can create problems in information retrieval because:

uBio is working on tools for providers of biological information that address these problems.

The uBio Taxonomic Name Server acts as a name thesaurus.

Names have many different classes of relationships that can be used to organize and retrieve information that is annotated with names. These classes are divided into two inter-connected services.

NameBank is a repository of millions of recorded biological names and facts that link those names together. [more]

ClassificationBank stores multiple classifications and taxonomic concepts that are the result of expert opinions. It extends the functionality of NameBank. [more]

All data within these components are linked to mechanisms that provide credit and attribution to experts who provide name and linkage information within the TNS. [more]

Lastly, NameBank promotes the emergence of a layered biological informatics infrastructure that allows different expert systems to share common information. This conserves scarce resources and enhances the means to support continued expert work.

A foundation for collaboration

We are currently pursuing funding to separate the two logical components of the Taxonomic Name Server into separate services.

NameBank will become a biological name server focused on serving factual nomenclatural metadata. The ClassificationBank component derive taxonomic concepts from cached NameBank records. Formalizing this division into discreet components provides us with increased collaborative opportunity by facilitating multiple taxonomic models atop a common core set of factual metadata.

Different taxonomic systems can share common facts

A common nomenclatural resource allows different information systems to address different taxonomic issues, scopes, or user communities while sharing common reference data. Collaboration eliminates duplication, increases accountable attribution of work, and provides a common interchange core. A contributor to NameBank ca

We seek to establish that such an approach is technically sound and can reduce inefficient duplication and derivation of established facts while promoting a more effective attribution pathway that can increase the reach of the taxonomic profession without compromising quality. NameBank can also enhance interoperability between different infrastructures by providing a common address space.

The difference between a vocabulary and a taxonomy is that the latter organizes the terms in a hierarchical relationship.

-- Jack Krupansky

8 Comments:

At October 7, 2016 at 7:40 AM , Blogger Joseph Russo said...

On this subject internet page, you'll see my best information, be sure to look over this level of detail.
Kirkland Plumber

 
At November 6, 2016 at 7:10 AM , Blogger رضا رمضان said...

شركة تتميز بجميع الخبرات في تقديم اعمالها المتميزة في الكشف عن التسريبات من خلال شركة كشف تسربات المياه بجدة التي تعطي كل ما لديها في اصلاح العديد من المشاكل التي تحدث نتيجة كسر او عطل مفاجئ في امدادت المياه لذلك ننصحم ان تعتمد علي شركة كشف تسربات بجدة لديه سباكين وفنين لديهم الخبرة في حل هذه المشكلة بكل سهولة كما نمتلك لديها القدرة علي تنفيذ اعمال العوازل من خلال شركة عزل اسطح بالرياض التي تعالج تسريبات المياه في الاسقف والحوائط كما نقدم خدمة العزل السليمة للخزانات الارضي والعلوي الخرسانية بواسطة فني متميزة لديه القدرة علي معالجة كل ذلك بسهولة من خلال شركة عزل خزانات بالرياض تمتلك مواد ذات جودة متميزة

 
At November 8, 2016 at 8:57 AM , Blogger RAGAB KAMAL said...



In the name of God the Merciful We in the light of UK companies offer the best services in all cleaning Katenziv in apartments , boards and cabinets and Villas
شركة نور المملكة
شركة تنظيف بمكة
And also we provide insect control for all insects flying and crawling and rat extermination
شركة مكافحة حشرات بجازان
We also offer moving furniture needed by everyone because of the expiration of the lease time or travel service
شركة الصفرات لنقل الاثاث بالرياض
And safety and God's mercy and blessings
كما يوجد لدينا ايضا تنظيف المجالس والكنب والسجاد والموكيت باحدث الطرق الموجودة وافضل المواد التى تقضى البقع والاوساخ
شركة تنظيف مجالس وكنب بحائل
شركة تنظيف سجاد وموكيت بحائل
وكل هذا بانسب الاسعار واقل التكلفة ونحن نعمل فى خدماتكم 24ساعه

 
At November 8, 2016 at 9:04 AM , Blogger RAGAB KAMAL said...


بسم الله الرحمن الرحيم نحن فى شركة الكمال تقوم بافضل انواع التنظيف العام وتنظيف الفلل بافضل انواع العالميه التى تحافظ على السيراميك

شركة الكمال
شركة تنظيف بالطائف
شركة تنظيف فلل بالطائف
شركة تنظيف بجازان
شركة تنظيف فلل بجازان
شركة تنظيف بحائل
شركة تنظيف فلل بحائل
ونحن فى خدماتكم اربعه وعشرون ساعه وكل هذا بافضل الاسعار واقل التكلفة


 
At November 10, 2016 at 4:47 AM , Blogger MASA AL said...

thanx,Nice info شركة رش مبيدات بجدة الشركة الاولى فى المملكة والتى تعتبر افضل شركة رش مبيدات بجدة كمان اننا نضمن لك الجودة والتوفير لاننا ارخص شركة رش مبيدات بجدة ونقوم بمساعدتك على إبادة الحشرات فى شركة رش حشرات بجدة ونقوم بمكافحة الحشرات أيضاَ فى شركة مكافحة حشرات بجدة والتى تعتبر افضل شركة مكافحة حشرات بجدة بل وتعبر كذلك ارخص شركة مكافحة حشرات بجدة

 
At November 10, 2016 at 4:47 AM , Blogger MASA AL said...

its very Nice شركات الماسة تقدم لكم شركة جلى رخام جدة فنحن نساعدك على عمل جلى رخام جدة حيث أن شركتنا شركة جلى بلاط جدة لديها أفضل ماكينات جلى بلاط جدة كما اننا فى شركة شركة جلى سيراميك جدة لدينا احدث أدوات جلى سيراميك جدة كما ان شركتنا تعتبر افضل شركة جلى رخام جدة وبشهادة العملاء نعتبر افضل شركة جلى بلاط جدة ونعتبر أيضا افضل شركة جلى سيراميك جدة كما أن لدينا افضل اسعار جلي بلاط جدة

 
At November 10, 2016 at 4:48 AM , Blogger MASA AL said...

Very Nice شركة مكافحة حشرات بجدة انها شركة الماسة والتى تتميز أيضاً أنها شركة رش حشرات بجدة وعلى مر الأيام أصبحت شركة الماسة افضل شركة رش مبيدات بجدة كم أصبحت أيضاً افضل شركة مكافحة حشرات بجدة نعمل سوياً على إبادة جميع الحشرات والقوارض فى شركة مكافحة حشرات بجدة كما أننا لدينا أفضل المبيدات الحشرية فى شركة رش مبيدات بجدة

 
At August 17, 2017 at 9:48 PM , Blogger عبده العمراوى said...

شركة قمة الدقة للخدمات المنزلية
شركة امست للتنظيف بالخبر
شركة مكافحة حشرات بالدمام

 

Post a Comment

Subscribe to Post Comments [Atom]

<< Home